Des centaines de personnes ont été tuées et des millions d'autres déplacées alors que des inondations dévastatrices balaient l'Afrique — frappant au lendemain d'une sécheresse paralysante qui avait déjà anéanti des moyens de subsistance.

Ce qui n'était autrefois que des épisodes isolés fait désormais partie d'un schéma inquiétant d'extrêmes climatiques sur le continent, où les pays oscillent entre sécheresse, pluies torrentielles, cyclones et inondations dévastatrices.

« Ce que nous observons dans certaines parties de l'Afrique australe, orientale et centrale est un phénomène climatique bien documenté souvent décrit comme un “whiplash climatique” : des basculements rapides d'une sécheresse prolongée à des inondations intenses au sein d'une même saison ou de saisons consécutives », déclare Marie Roseline Belizaire, responsable des urgences au bureau régional Afrique de l'Organisation mondiale de la santé, à TRT Afrika.

La trajectoire récente de la région illustre crûment cette réalité.

L'Afrique australe sortait de la dévastatrice sécheresse de 2023–2024 liée à El Niño, l'une des pires depuis des décennies, pour être plongée ensuite dans de fortes pluies et des inondations liées à La Niña à la fin de 2025 et au début de 2026.

Choc climatique

Entre la mi-décembre 2025 et février 2026, on estime qu'environ 1,9 million de personnes ont été touchées par des inondations et des cyclones, plus de 370 ont perdu la vie et plus de 175 000 ont été déplacées, en particulier au Mozambique, à Madagascar et en Afrique du Sud.

Pourtant, la destruction dépasse largement les habitations submergées et les routes emportées.

Les eaux d'inondation coupent aussi l'accès aux services de santé, contaminent l'eau potable et paralysent les systèmes d'assainissement. Dans leur sillage survient une flambée de maladies : choléra, diarrhée aqueuse aiguë, paludisme et infections respiratoires.

Les soins de routine, services maternels, traitements du VIH et de la tuberculose, et programmes de vaccination, subissent des perturbations dangereuses.

« Autrement dit, les communautés ne perdent pas seulement leurs moyens de subsistance et leurs abris ; elles font également face à une urgence secondaire de santé publique », alerte Belizaire.

« L'épidémie de choléra qui était presque maîtrisée au Mozambique a de nouveau augmenté après les inondations et se poursuit. La Namibie, le Zimbabwe et le Malawi enregistrent aussi des pics de cas de paludisme. »

Parmi les pays les plus touchés, le Mozambique représente près de la moitié des personnes affectées dans la région.

En réponse, l'Organisation mondiale de la santé travaille en étroite collaboration avec les gouvernements et les partenaires pour atténuer la crise.

Dès qu'une catastrophe survient, les équipes interviennent rapidement pour évaluer les dégâts et coordonner les réponses sanitaires en déployant des systèmes de surveillance des maladies, livrant des kits choléra et des médicaments essentiels, installant des cliniques mobiles et renforçant les services d'eau, d'assainissement et d'hygiène dans les sites de déplacement.

Les soins obstétriques et néonatals d'urgence sont également une priorité.

« La priorité est de sauver des vies tout en évitant une seconde crise provoquée par des flambées de maladies et la perturbation des services essentiels », souligne Belizaire.

Mais l'ampleur du défi s'accroît. L'Afrique supporte l'une des charges les plus lourdes d'urgences de santé publique au niveau mondial, comptant pour près de 60 % des événements majeurs, plus de 100 par an. Ces crises vont des épidémies et des catastrophes climatiques aux urgences humanitaires, souvent simultanées.

Dans un tel contexte, la responsable des urgences de l'OMS Afrique insiste : la préparation aux urgences n'est plus optionnelle pour le continent. Elle est au cœur de la protection des vies — détecter les menaces tôt, coordonner des réponses rapides, maintenir les services de santé essentiels et protéger les plus vulnérables.

Financement de la santé

Pourtant, l'un des obstacles les plus persistants reste le financement. Selon Belizaire, le problème n'est pas seulement un manque de ressources, mais un manque de priorisation.

« Les urgences sanitaires sont encore trop souvent financées par des appels de fonds et des mesures de contingence, plutôt que traitées comme des investissements publics fondamentaux, essentiels à la sécurité nationale, à la stabilité économique et à la cohésion sociale », note-t-elle.

Elle plaide pour que les gouvernements africains dépassent les promesses et respectent la Déclaration d'Abuja, en garantissant un financement intérieur prévisible pour la préparation et la réponse. Des fonds d'urgence dédiés aux niveaux national, régional et continental doivent être entièrement dotés et conçus pour un déploiement rapide, précise-t-elle.

Parallèlement, une gestion financière renforcée et des stratégies innovantes de mobilisation de recettes domestiques pourraient permettre d'étirer davantage des ressources limitées.

« Les mécanismes mondiaux tels que le Fonds pandémique peuvent aider mais ils ne peuvent pas remplacer la responsabilité nationale. En fin de compte, des systèmes de réponse aux urgences résilients ne se construiront pas sur la dépendance à l'aide, mais sur un engagement politique soutenu en faveur de la santé en tant que bien public et investissement stratégique », affirme-t-elle.

Au cœur de cet effort doivent se trouver les communautés elles‑mêmes. Les experts insistent pour que les personnes les plus affectées ne soient pas traitées comme de simples bénéficiaires passifs, mais comme des partenaires actifs dans l'élaboration des solutions.

Cela implique d'écouter les voix locales, de travailler avec des leaders de confiance, des groupes de femmes, des réseaux de jeunes et des agents de santé de première ligne — et de s'assurer que leurs contributions orientent à la fois la réponse d'urgence et la reconstruction à long terme.

« Des solutions durables émergent lorsque les communautés contribuent à définir les priorités, à identifier les obstacles et à tenir les intervenants responsables », déclare Belizaire. « C'est ainsi que la réponse aux urgences devient plus équitable, plus efficace et plus digne de confiance. »